どんなツールか？
デスクトップアプリとして人気のあるCytoscapeのブラウザ実装版です。
ネットワーク（グラフ）データをブラウザ上でインタラクティブに可視化するツールです。ノード（点）とエッジ（線）で構成される関係性データを読み込み、レイアウトの変更、属性によるスタイリングなどを直感的に操作できます。
Cytoscapeはネットワーク（グラフ）データを可視化・解析するオープンソースのプラットフォームです。もともとは生物学（分子間相互作用ネットワーク）の可視化・解析用に開発されましたが、ソーシャルネットワーク分析や複雑ネットワークの可視化全般にも利用されます。
機能
- データの読み込み — GEXF、GraphML、CSV形式のファイルをアップロードして可視化
- サンプルデータセット — Les Misérables、Game of Thrones、Marvel Universeなど9種類のサンプルデータをワンクリックで読み込み
- レイアウト切替 — Grid、Circle、Concentric、Breadthfirst、Cose（物理シミュレーション）、Randomの6種類
- ノードのスタイリング — 属性に応じた色（定性的カラースキーム）、サイズ、ラベルの動的変更
- エッジのスタイリング — 属性に応じた色（定量的カラースキーム）、太さ、ラベルの動的変更
- SVGエクスポート — 現在のグラフをSVG形式でダウンロード
- プロジェクトの保存・読込 — サーバーにプロジェクトを保存し、後から復元可能
使い方
- 「データファイルの読込」ボタンからファイルを選択、または「サンプルデータの読込」から選択
- コントロールパネルでレイアウトやイージングを変更してグラフの配置を調整
- 「ノード」行のドロップダウンでノードの色・サイズ・ラベルに使う属性を選択
- 「エッジ」行のドロップダウンでエッジの色・太さ・ラベルに使う属性を選択
- 必要に応じて「エクスポート」でSVG画像として保存
データ形式
GEXF / GraphML
グラフ専用のXML形式です。ノードとエッジの属性（カテゴリ、重み、座標など）を豊富に記述できます。GephiやNetworkXなど多くのツールからエクスポート可能です。
CSV（エッジリスト形式）
スプレッドシートやExcelから手軽に作成できる形式です。
- ヘッダー行が必須です
sourceとtarget列（またはfromとto）でエッジの両端を指定します（大文字小文字は区別しません）- それ以外の列はエッジの属性として読み込まれます
- ノードはエッジの情報から自動的に生成されます
source,target,weight,type
Alice,Bob,1.0,friends
Bob,Carol,2.5,colleagues
Alice,Dave,0.8,family